Джедаи в ловушке на Фелуше. Клоны окружены отрядом дроидов, спасти их могут только лишь республиканские штурмовики, готовые при первой же возможноти приземлиться на поверхность. Крейсерам джедаев удалось прорвать защиту дроидов и послать на помощь штурмовики.
Украдены секреты дарт Сидиус нанял мерзкого наемника Кад Бейна чтобы украсть Голокрон из хранилища храма джедаев. Бейн сбежал с места приступления, выследил и взял в плен мастера Пола Ропола, у которого хранится кристал с секретами джедаев. Флот сипаратистов прибыл на помощь наемнику. Энакин Скайуокер поспешит на перехват, чтобы не дать Бейну продать похищеный Голокрон.
В погоне за вором, Энакин Скайуокер вместе со своим подаваном Осокой высадился на корабль хитрого наемника Када Бейна, чтобы вернуть украденный Голакрон, который содержит список всех детей в галактике способных чувствовать силу, будущих рыцарей джедаев. После отчаяной погони и схватки со злодеем клоны во главе с Энакином разгромили Бейна, но им пришлось эвакуироваться с обреченного корабля, без Голакрона...
В Сенате предатель! Совет джедаев подозревает, что сенатор Раш Кловис участвует в заговоре сепаратистов. Чтобы узнать замыслы сенатора от Скипио, Совету нужен свой собственный шпион.
Пока армия клонов прочёсывает Галактику, безуспешно пытаясь обнаружить флот генерала Гривуса, планеты Сепаратистов, ранее нейтральные, теперь восстают против Республики.
На Джеонозисе лидер сепаратистов Поггль Младший, укрыв свои новые фабрики надёжным силовым полем, тысячами штампует новые ужасные виды боевой техники, которые прямо с конвейера отправляются в бой.
Джедаи, стремясь во что бы то ни стало восстановить порядок в Республике, подготовили массированное вторжение, чтобы захватить Джеонозис и закрыть фабрики Поггля раз и навсегда.
Узнав, что диктатор Поггль Младший восстановил фабрику дроидов на Джеонозисе, рыцарь-джедай Энакин Скайуокер со своим падаваном Асокой Тано готовятся к штурму хорошо укреплённого сооружения. Их главная задача: уничтожить фабрику любой ценой. Предполагая упорное сопротивление, республиканское командование направило им на помощь мастера-джедая Луминару Ундули и её падавана Бэррис Оффи.
Но у наших отважных героев мало времени, строительство опасной фабрики близко к завершению...
После массированной осады планеты оплот сепаратистов на Джеонозисе пал. Главная оружейная фабрика была уничтожена ценой огромных потерь для республиканской армии.
Луминара Андули и Обиван Кеноби приступили к зачистке планеты. Они бросили все силы на поиски лидера сепаратистов Поггля Младшего, чтобы доставить его в трибунал.
Сломив оборону сепаратистов Республиканцы захватили планету и уничтожили главную оружейную фабрику по производству дроидов. Поиски Поггля привели Луминару Андули к королеве Карине Великой, управлявшей своими солдатами даже после их смерти. Разрушив дворец королевы, джедаи захватили её ставленника - Поггля Младшего.
Дждедаи должны отвезти Поггля на Корусант, чтобы он предстал перед судом. А Асоке и Бэррис поручили доставить медикаменты мастеру Винду на Дантуин.
Гривус снова сбежал! Хотя республиканцам сопутствует удача в боях с сепаратистами во Внешнем Кольце, джедаям так и не удалось поймать неуловимого генрала Гривуса.
Он подстроил ловушку для членов Совета Джедаев, но после жестокой схватки генералу пришлось высадиться на планету Селюкамай. Погоня в самом разгаре...
Война открыла новые возможности для преступного мира...
Беспощадные наёмники, вступив в сговор с сепаратистами, подрывают и без того нестабильную ситуацию в Республике. Энакин Скайуокер и Асока Тано проверяют убежища вероломных бандитов в поисках продажного и подлого торговца, продающего оружие врагам Республики на чёрном рынке.
Дипломатия или предательство? Совет нейтральных систем, объединяющий почти полторы тысячи миров, хочет остаться в стороне от военных действий. Но до Сената Республики дошли слухи, что новый руководитель Совета, герцогиня Мандалора - Сатин, втайне создаёт собственную армию, чтобы сражаться на стороне Сепаратистов. Мастер-джедай Оби-Ван Кеноби отправляется на Мандалор , чтобы проверить истинность этих слухов.
Великолепный прием! Пытаясь выяснить, правда ли Мандалор собирается присоединиться к сепаратистам, Оби-Ван Кеноби встретился с герцогиней Мандалора - Сатин. Герцогиня заявила о намерении Мандалора оставаться нейтральной стороной в этой войне. Но нападение на столицу помогло Оби Ван раскрыть террористическую организацию Стражей смерти. Герцогиня направляется в сенат, что бы подтвердить свой нейтралитет в войне между республикой и сепаратистами, а джедаи готовы защитить её от нападения врагов.
Дипломатическая миссия! Разногласия грозят нарушить мир в системе Мандалор.
Герцогиня Сатин изо всех сил старается защитить свой народ от эскалации насилия. Несмотря на предательство двух верных союзников, Сатин прибывет на Корусант в надежде убедить Сенат, что радикальная группировка Стражей Смерти действует не от имени мандолорского правительства.
Найти истину не сложно. Смириться с ней намного труднее.
Бои на всех фронтах! Пока клоны проливают свою кровь в сражениях, в Галактическом Сенате идёт другая война.
Ввиду тяжёлых потерь группа сенаторов во главе с Хале Батони от Камино предложила увеличить производство клонов.
Сенатор Падмэ Амидала, считая, что увеличение численности войск лишь продлит боевые действия, вместе с союзниками добивается принятия решения о сокращении военных расходов и прекращении производства клонов.
Непреодолимая блокада. Корабли сепаратистов блокируют планету Кристопсис богатую ископаемыми. Сенатор Бэлл Органа оказался в ловушке. Посланные ему на помощь корабли Республики под командованием рыцаря - джедая Энакина Скайуокера должны прорвать блокаду. Но время на исходе как у сенатора так и у жителей Кристопсиса
Храбрость делает тебя героем но только доверие пораждает дружбу.
Число погибших растет. Бои становятся ожесточеннее и война охватывает все больше миров Республики. Планеты вынуждены сами искать себе защиту, поскольку джедаи не в силах помочь всем. На рубеже линии обороны были оборудованы медицинские станции но они оказались легкой добычей для атак сепаратистов. Связь на орбите Фелуции была прервана. Оби Ван Кеноби, Энакин Скайуокер и Осока Тана летят туда выяснить в чем дело.
Выбери правильный путь, а не тот по которому легче идти.
Отчаянные времена требуют отчаянных мер! В одном из самых продолжительных и жестоких сражений войны Сепаратисты почти захватили планету Маластар. Если Республика потеряет эту планету, это будет стоить ей жизненно важных топливных запасов, необходимых для поддержания её армий. В последней попытке изменить ход битвы, Верховный Канцлер Палпатин санкционировал использование новейшего Республиканского оружия: электро-протонной бомбы.
Республика транспортируют зверя Зилло на Корусант для изучения. Но когда чудовище сбегает, перед джедаями стоит выбор - спасти жизни миллионов людей или уничтожить последнего в своем роде зверя.
Молодой Боба Фетт ведет войну против джедаев, которые сделали его сиротой. В помощь себе он нанимает некоторых из самых смертоносных охотников за наградами в галактике - Кастаса, Кэда Бейна, Орру Синг и Босска.